Fakulteti Filozofik është i përfshirë në një numër projektesh kërkimore. Për të mundësuar, lehtësuar dhe publikuar kërkimin shkencor, në Fakultetin Filozofik veprojnë institutet kërkimore dhe botohen periodikët shkencorë.

Periodikët:

Kosova Anthropologica

Institutet kërkimore:

Instituti i Antropologjisë (IAUP)

Instituti i Psikologjisë

Instituti i Sociologjisë

Instituti për Studime Sociale dhe Humanistike (ISSH)